국내 산업용 효소 시장은 약 7000톤으로 추정되고 있으며 비중이 사료용 43%, 식품용 18%, 세제용 10%, 제약 및 특수 효소 29%로 나타나고 있다.
CMRI(화학경제연구원)가 2015년 6월 발간한 <헬스케어 케미칼 기능성 첨가제-효소·아미노산> 보고서에 따르면, 효소는 기존 화학공정을 대체함으로써 친환경적으로 자원효율을 높이고 에너지를 절감시켜 환경오염을 막을 수 있는 첨가제로 높은 성장성이 기대되고 있다.
산업용 효소는 식품, 사료, 세제, 치료약품 등에 적용되는 범용 효소와 진단 및 연구, 특수 목적에 사용되는 스페셜티 효소로 구분되고 있다. 범용 효소는 글로벌 메이저들이 장악하고 있으나 사료용 효소는 국산화가 가속화되고 있다.
반면, 국내 바이오 벤처기업들은 특수 효소 시장에서 메이저들과 승부하고 있다.
아미코젠은 항생제 특수효소를 내세워 중국시장에 진출했으며, 제노포커스는 카탈라아제(Catalase)를 삼성전자에게 반도체 세척공정용으로 공급하고 있다.
국내 특수효소 시장은 범용과 비교해 규모가 작지만 고부가가치를 기대할 수 있어 국내기업들이 개발에 집중하고 있다.